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Infrastructure de Biologie Spatiale SpOT : lancement des premiers projets pilotes sur le COMET

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  • Le 04 mai 2026
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L’infrastructure SpOT a acquis son premier équipement mutualisé, le COMET. Il permet d’upgrader l’offre d’imagerie multiplexée déjà présente sur la plateforme MicroPICell, possédant déjà un Phenocycler.   L’équipe de MicroPICell, et en particulier la responsable des projets multiplex protéiques Aurélie Doméné, va développer sa mise au point et son ouverture en service plateforme grâce à 3 projets pilotes portés par les laboratoires RMeS, le CR2TI et le CRCI2NA. L’équipement sera accessible à tout projet de recherche après ces mises au point. Une démonstration à destination des futurs utilisateurs sera organisée à l’automne.

SpOT est une infrastructure de recherche distribuée. Cela signifie qu’elle coordonne les expertises des collègues nantais dans le domaine de la biologie spatiale. Elle pilote également l’acquisition de nouveaux équipements et leur installation au sein des laboratoires et des plateformes du site. COMET
Ainsi, SpOT a fait le choix d’installer le COMET sur la plateforme MicroPICell, située au 4e étage de l’IRS-UN. MicroPICell est reconnue pour son expertise dans la prise en charge optimale et complète de tout type d’échantillons (déshydratation, enrobage, coupe, validation de la qualité des tissus par colorations histologiques, marquages préalables aux analyses, préparation de TMA) et leur imagerie.

MicroPICell est d’ores-et-déjà dotée du Phenocycler qui permet le marquage d’une quarantaine de protéines au sein de tissus, et a également développé d’autres approches multiplex. L’acquisition du COMET renforcera les capacités d’analyse de l’infrastructure en permettant l’utilisation de lames de microscopie classiques ou analysées en transcriptomique spatiale, d’augmenter le débit d'acquisition, de permettre l’analyse de plusieurs dizaines de protéines et de dizaine de gènes.

COMET lame Trois projets pilotes vont valider la mise au point du COMET sur des typologies de tissus différentes.

  • Le premier étudiera la diversité des cellules immunitaires synoviales au cours de l’arthrose. Il est porté par Marie-Astrid Boutet (CRCN, RMeS, Equipe REJOINT).
  • Le second permettra de comprendre le rôle de TCL1A après transplantation d’organes, sur biopsies rénales. Richard Danger (CRCN CR2TI, Equipe 4) en est le porteur.
  • Le troisième projet vise à comprendre le lien entre plasticité cellulaire, cil primaire et cancer – porté par Vincent Guen (CRCN CRCI2NA, Equipe 7b).
 

Le COMET est l'un des 4 équipements identifiés dans le cadre de l'appel à projet "Infrastructure ligérienne" de la région Pays de la Loire. Il est financé grâce au soutien de France BioImaging via le Plan France Relance 2023 (ANR-24-INSB-0005 FBI BIOGEN).

Mis à jour le 04 mai 2026.