L’Edition du génome : un service déployé sur la plateforme iPSC

Direction le bâtiment de l’IRS-UN, au 6ème étage où nous accueille Sarah Tessier, ingénieure d’étude sur la plateforme iPSC. Depuis 2023, elle a rejoint la plateforme avec un objectif principal : prendre en charge les projets d’édition du génome.
 

« Les enjeux scientifiques et applicatifs sont considérables » nous explique-t-elle. L’édition du génome permet de créer des modèles cellulaires précis pour explorer les conséquences de perturbations génétiques. « Nous sommes capables de muter ou corriger génétiquement des cellules souches pluripotentes. Celles-ci peuvent ensuite être utilisées pour de la différenciation en modèles 2D ou 3D comme la formation d’organoïdes » . Ces modèles ouvrent de nouvelles perspectives en médecine régénérative et personnalisée pour comprendre les mécanismes de développement et de maladies humaines.

Depuis son arrivée, Sarah a optimisé l'ensemble des protocoles. Elle propose désormais aux scientifiques un processus d’une très grande fiabilité, reproductibilité et rapidité. Ceci grâce entre autres à l’acquisition d’un automate Cell-Celector. Il effectue des repiquages automatisés et de haute précision de colonies de cellules souches pluripotentes et d’organoïdes (sous-clonage).

En équipe avec Rozenn Le Bloas et leurs collègues de la plateforme, elles ont pris en charge une trentaine de projets, dont une vingtaine sont désormais terminés et validés. Les objectifs de recherche étaient multiples. Ils consistaient à étudier la perte de fonction de certains gènes ou à introduire des mutations spécifiques. La plateforme a également généré diverses lignées transgéniques exprimant des systèmes de régulation de l'expression des gènes. 

N'hésitez pas à contacter la plateforme pour leur faire part de vos projets !

Légende :
1. Sarah Tessier (iPSC – BioCore) en train de remettre en culture des lignées cellulaires à éditer sous un PSM
2. Cellule iPSC vue au microscope
3. Anne Gaignerie (ION - BioCore) utilisant le Cell Celector* pour isoler des organoïdes sélectionnés


* Le Cell Celector a été acquis par Nantes Université dans le cadre d'un soutien aux infrastructures de recherche - Equipements spécifiques Programmation 2014-2020 (co-financé par la région pays de la Loire et le fond européen de développement régional) et porté par la SFR Bonamy

Ce service a été développé grâce au soutien de Biogenouest - Pays de la Loire 2023/2025